وێنە بکە core biopsyـیەکی بچووک هەیە بۆ نەخۆشێک کە بۆ clinical trial هەڵدەسەنگێنرێت. tissue کەمە، بەڵام داواکارییەکان زۆرن: H&E، چەند IHC marker، و ڕەنگە NGS یان تاقیکردنەوەیەکی multi-omic. هەر sectionـێکی زیادە tissue دەخوات. هەر ڕۆژێکی چاوەڕوانی دەتوانێت چوونەناوی نەخۆش بۆ trial یان هەڵبژاردنی چارەسەر دوا بخات.
ئەمە ئەو شوێنەیە کە ViewsML دەیەوێت کاری تێدا بکات. کۆمپانیاکەی Vancouver seed roundـێکی 4.9 ملیۆن دۆلاری ڕاگەیاند، بە سەرکردایەتی Wittington Ventures، و بە بەشداری Mayo Clinic و Continuum Health Ventures و پشتیوانانی پێشووتر وەک Debiopharm. بۆ پاتۆلۆژیست، خاڵی گرنگ تەنها ژمارەی پارەکە نییە. گرنگییەکە لە ئاراستەکەدایە: گۆڕینی بەشێک لە biomarker staining لە wet-lab procedure بۆ software layer کە لەسەر digital H&E slide دروست دەبێت.
ViewsML چی دەڵێت دروستی دەکات؟
ViewsML پلاتفۆرمەکەی وەک virtual biomarker library ناساندووە. بیرۆکەکە ئەوەیە AI model وێنەی H&Eـی دیجیتاڵ وەردەگرێت و دابەشبوونی biomarkers لە ئاستی خانە پێشبینی دەکات، بۆ ئەوەی virtual IHC یان دەرچوونێکی هاوشێوەی virtual immunofluorescence بدات. ئامانجەکە تەنها ئەوە نییە بڵێت نموونەکە biomarker-positive یان biomarker-negative ـە. ئامانج spatial mapping ـە: protein لە کوێی tumor epithelium دەردەکەوێت؟ لە immune compartment چی؟ لە stroma یان vasculature چی ڕوو دەدات؟
ئەم وردەکارییانە لە immuno-oncology و antibody-drug conjugates و bispecific therapies گرنگن. لەم بوارانەدا، هەموو پرسیارەکە ئەوە نییە marker هەیە یان نییە. دابەشبوونی شوێنی و heterogeneity ناو tumor دەتوانن بەشێک بن لە تێگەیشتن لە وەڵامی چارەسەر، هەڵبژاردنی نەخۆشان، یان ڕاڤەکردنی ئەنجامی clinical trial.
بۆچی بەشداری Mayo Clinic گرنگە؟
Mayo Clinic وەک وەبەرهێنەری نوێ چووە ناو roundـەکە، بەڵام پەیوەندی لەگەڵ ViewsML لە پارەدانەکەوە دەستی پێنەکردووە. بەگوێرەی R&D World، ViewsML پێشتر بەشێک بووە لە ecosystemـێکی فراوانتری Mayo Clinic Digital Pathology، کە شارەزایی کلینیکی و data و infrastructure و داهێنەرانی دەرەکی AI کۆدەکاتەوە. وەبەرهێنانەکە لە هاوکاری کلینیکی جیاوازە، بەڵام نیشانەیەکە کە Mayo بە جدی چاودێری virtual staining دەکات.
لێرەدا جیاوازییەکە گرنگە: digital pathology وەک گۆڕینی slide بۆ وێنە، جیاوازە لە digital pathology وەک چینێکی نوێی زانیاری لەسەر H&E. زۆر لابۆراتوار scanning دەست پێدەکەن، بەڵام بەهای WSI تەواو دەرناکەوێت ئەگەر وێنەکە تەنها جێگرەوەی glass slide بێت. بەهاکە دەست پێدەکات کاتێک وێنەکە دەبێتە سەرچاوەی quantification، spatial mapping، triage، و گرێدانی morphology بە biomarkers.
لە H&E بۆ virtual IHC
لە کاری ئاساییدا، biomarker profiling زۆرجار پشت بە IHC دەبەستێت، پاشان molecular testing وەک NGS. ئەم ڕێگایە ناسراوە، بەڵام کات و tissue دەخوات. ViewsML دەڵێت بەشێک لەم پرۆسەیە دەتوانرێت بکرێتە software: model شوێنی protein لە H&E پێشبینی دەکات و virtual biomarker stain ڕاستەوخۆ لە وێنەی دیجیتاڵ دەدات.
ئەگەر ئەم جۆرە ئامرازە لە کلینیکدا خۆی بسەلمێنێت، بەکارهێنانی نزیکتر ئەوە نییە کە IHC لەناکاو بسڕێتەوە. بەکارهێنانی واقیعیتری triage و stratification ـە. model دەتوانێت یارمەتی بدات ئەو حاڵەتانە دیاری بکرێن کە زوو پێویستیان بە confirmatory testing هەیە، یان کات و tissue باشتر ڕێکبخرێت کاتێک biopsy بچووکە. ئەمە بە تایبەتی لە lung cancer، GI biopsies، و metastatic samples گرنگە کە tissue هەندێک جار تەنها بۆ diagnosis و molecular workup بەس دەکات.
جیاوازی لەگەڵ زۆر ئامرازی AIـی پاتۆلۆژی
بەشێکی زۆری AI pathology ئەمڕۆ لەسەر detection یان classification کار دەکات: هەبوونی شێرپەنجە، grade، subtype، یان biomarker statusـی گشتی. ViewsML دەیەوێت چینێکی وردتر بدات: per-cell prediction لەگەڵ spatial context. ئەمە گفتوگۆکە نزیک دەکاتەوە لە spatial biology زیاتر لە image classificationـی سادە.
کۆمپانیاکە هەروەها باس لە virtual multiplexing دەکات. لەبری ئەوەی چەند biomarkers بە شێوەی فیزیکی لە tissue stain بکرێن، سیستەمەکە دەتوانێت چەند چینێکی virtual دروست بکات و بە شێوەی computational یەک بخات. ئەگەر ئەمە باوەڕپێکراو ببێت، biopharma دەتوانێت tumor microenvironment لە نموونەی هەبوو بخوێنێتەوە، بێ ئەوەی tissueـی زیاتر ببڕێت یان staining panelsـی گران دووبارە بکاتەوە.
پاتۆلۆژیست پێش متمانەکردن بە virtual staining چی پێویستە؟
حەماسەت بە تەنها بەس نییە. هەر virtual staining model پێویستی بە validationـی توند هەیە بەرامبەر ground truthـی ڕوون. پێویستە بزانین model لەسەر چ جۆرە samples ڕاهێنراوە، چ جۆرە tumorـان دەگرێتەوە، چ scanners بەکارهاتوون، fixation و staining variation چۆن کاریگەری لە performance دەکەن، و ئایا لە نێوان لابۆراتوارەکاندا بەهێز دەمێنێتەوە یان نا.
دەرچوونەکەش دەبێت بۆ پاتۆلۆژیست قابل مراجعة بێت. ئایا probability map ـە؟ دەتوانرێت ئەو خانانە ببینرێن کە model پێشبینییەکەی لەسەر بنیات ناوە؟ thresholds ڕوونن؟ کەی دەبێت IHCـی پشتڕاستکەرەوە داوابکرێت؟ ئەمانە پرسیاری کاری ڕۆژانەن.
هەروەها سنووری regulatory هەیە. بەکارهێنان لە biopharma research یان clinical trial enrichment جیاوازە لە بەکارهێنانی ڕاستەوخۆ لە routine diagnostic sign-out. بۆیە باشترە هەواڵی ViewsML وەک هەنگاوێک بۆ workflowsـی یارمەتیدەر بخوێندرێتەوە، نەک جێگرەوەیەکی دەستبەجێ بۆ IHC یان بڕیاری پاتۆلۆژیست.
بۆچی ئەمە بۆ لابۆراتوارەکانمان گرنگە؟
بۆ ئەو لابۆراتوارانەی بیر لە digital pathology دەکەنەوە، پەیامەکە ڕوونە: scanning بە تەنها کۆتایی ڕێگاکە نییە. WSI کاتێک بەهادارتر دەبێت کە دەرگا بکاتەوە بۆ ئامرازەکان کە tissue دەپارێزن، کاتی چاوەڕوانی کەم دەکەنەوە، و یارمەتی هەڵبژاردنی تاقیکردنەوەی داهاتوو دەدەن. ئەمە مانای ئەوە نییە هەموو لابۆراتوارێک سبەی virtual staining پێویستە. بەڵام مانای ئەوەیە infrastructureـی دیجیتاڵ دەبێت بە شێوەیەک دروست بکرێت کە دواتر ئەم ئامرازانە هەڵبگرێت: image qualityـی جێگیر، metadataـی باش، و گرێدانی ڕوون لە نێوان وێنە و diagnosis و molecular findings.
چیرۆکی ViewsML و Mayo Clinic، virtual biomarker staining دەخاتە ناو خاڵی هاوبەشی digital pathology و precision medicine. ئەگەر ئەم models ـانە دقت و بەهای کاری خۆیان بسەلمێنن، H&E دەتوانێت زیاتر بێت لە slideـی دەستپێکی diagnosis. دەتوانێت ببێتە خاڵی دەستپێک بۆ پێشبینی biomarker spatial، لەگەڵ پاراستنی tissueـی ڕاستەقینە بۆ ئەو تاقیکردنەوانەی هێشتا پێویستن.
سەرچاوە: R&D World